この質問に答えるためには、まず、ワクチンが実際にどのように機能するかについて話しておくと便利かもしれません：基本的には、ウイルスや細菌（または最近では、ウイルスの外側を模倣した合成ウイルスのような粒子）の死んだバージョンまたは比較的無害な（減衰された）バージョンを導入することによって、あなたは自分自身を守るためにあなたの免疫システムによる反応を誘導します。
あなたの免疫システムは、通常、ウイルスや細菌の外側に遭遇したタンパク質（抗原）に基づいて、それが前に遭遇した病原体を覚えているように、それが本物に遭遇したとき、それは自分自身を守ることができます。
ワクチンが機能する能力は、あなたが与えられたワクチンとあなたが遭遇した病原体を “同じ "として認識するあなたの体の能力にentireally依存することを意味します。インフルエンザのように、いくつかのウイルスは、株間の入れ替わりに非常に有利なゲノムを持っています。これは、抗原性シフトとして知られています。他のウイルスは、HIVのようなは、「ずさんな」または誤りやすいゲノムのコピー方法によってもたらされた比較的急速な進化を持っています。
これらのメカニズムの両方は、時間をかけて、ワクチンとウイルスの間の違いは、あなたの体はもはや他のものとして1つを認識しないようなものであることが可能性が高いです。
HIVやインフルエンザのようなRNAウイルスとは対照的に、天然痘のようにゲノムが二本鎖DNAとして保存されているウイルスは、エラー率がはるかに低いを持っているため、抗原性のドリフトが少なく、抗原性のシフトが起こりにくいということです。このことは、天然痘に対して開発されたワクチンが、免疫反応を引き起こさないようにウイルスが進化しても効果がないことを意味しています（抗原性逃避として知られています）。