BIDという略語はどのように投薬に適用されるのでしょうか？

ご指摘の通り、BID＝ビス・イン・ダイ＝1日2回です。フロリダ大学の標準用量シートによると、BID＝12時間おきです。

しかし、私は看護師のためのフォーラム[参考文献参照]を読んでいたのですが、病院によってBIDにばらつきがあるようです（大体8〜12時間間隔）。

可能であれば、看護師/医師に連絡して明確にしてください。

References:

University of Florida Standards http://professionals.ufhealth.org/files/2011/11/1007-drugs-therapy-bulletin.pdf

Forum. http://allnurses.com/first-year-after/bid-strictly-every-795661.html